某小村中学，对考古具有浓厚兴趣的老师八部高史（竹中直人 饰）及其学生月岛令子（上野めぐみ 饰）在进行一项研究时双双失踪下大雨，大街上水很深。 很多车都过不去。一时间校内人心惶惶，各种流言猜测四起。行为怪张的考古学家稗田礼二郎（沢田研二 饰）应八部老师的邀请来到这所学校，他偶然救助了八部的儿子正雄（工藤正貴 饰）。正雄既担心父亲的安危，又惦念其所暗恋的女孩令子。稗田利用自己发明的妖怪探测器，在夜晚和正雄来到学校。结果发现，八部老师在考察一座古墓时，无意中释放了藏身其中的妖怪比留子。据说比留子是《古事记》中初神伊耶那岐和伊耶那美的孩子。她的复活，为平静的学校带来一阵腥风血雨…… 本片根据诸星大二郎的漫画《妖怪ハンター》改编。